而即使试探性谈判顺利进行，取得预定成果，此后的组阁过程依旧不轻松，而且也并不能保证最终组阁成功。

还有遴选委员透露，面谈的时候，管中闵曾表示，“台大既然是大学中的老大，还跟小弟争钱抢资源，成何体统？也无法服众！”他还表示以后如果当上台大校长，“不会做这种事”，非常霸气，多位委员认为台大现在萎靡不振，真的需要强势校长。

《两部门：破解社区足球场地设施建设六大难点问题》对于台湾渔民在冲之鸟海域捕鱼问题，马英九当局时期曾对日本据理力争，强调冲之鸟是“礁”不是“岛”。在蔡当局执政后，在“亲美日反中”的思维下，对冲之鸟争议的态度转趋暧昧。